Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1DP3Q658K8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEF1DP3Q658K8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms