Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms