Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EFHC1Q5JVL4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms