Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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RAB6CQ53S08 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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