Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIN7

RGL3, Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGL3Q3MIN7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGL3Q3MIN7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGL3Q3MIN7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms