Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NBPF8Q3BBV2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF8Q3BBV2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms