Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM1Q2NKQ1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms