Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CA9Q16790 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CA9Q16790 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CA9Q16790 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CA9Q16790 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CA9Q16790 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CA9Q16790 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CA9Q16790 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CA9Q16790 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CA9Q16790 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CA9Q16790 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CA9Q16790 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CA9Q16790 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CA9Q16790 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CA9Q16790 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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CA9Q16790 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CA9Q16790 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CA9Q16790 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CA9Q16790 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CA9Q16790 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CA9Q16790 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CA9Q16790 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CA9Q16790 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CA9Q16790 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CA9Q16790 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CA9Q16790 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CA9Q16790 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CA9Q16790 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CA9Q16790 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CA9Q16790 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CA9Q16790 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CA9Q16790 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CA9Q16790 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CA9Q16790 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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