Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST2H2BEQ16778 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST2H2BEQ16778 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST2H2BEQ16778 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST2H2BEQ16778 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST2H2BEQ16778 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST2H2BEQ16778 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST2H2BEQ16778 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST2H2BEQ16778 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST2H2BEQ16778 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIST2H2BEQ16778 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HIST2H2BEQ16778 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST2H2BEQ16778 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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