Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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