Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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