Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGB1Q14028 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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