Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SMAD4Q13485 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD4Q13485 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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