Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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