Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms