Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD47Q08722 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD47Q08722 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD47Q08722 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD47Q08722 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD47Q08722 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD47Q08722 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD47Q08722 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms