Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNG1Q06432 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms