Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms