Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms