Protein–RNA interactions for Protein: Q01589

SED1, Cell wall protein SED1, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1Q01589 snR54snR54 86 nt0.07□□□□□ -2.4
SED1Q01589 RCO1YMR075W 2055 nt0.07□□□□□ -2.4
SED1Q01589 MLP2YIL149C 5040 nt0.06□□□□□ -2.4
SED1Q01589 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.06□□□□□ -2.4
SED1Q01589 COX5BYIL111W 456 nt0.06□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YLR334CYLR334C 381 nt0.06□□□□□ -2.4
SED1Q01589 PRP42YDR235W 1635 nt0.05□□□□□ -2.4
SED1Q01589 MLP1YKR095W 5628 nt0.05□□□□□ -2.4
SED1Q01589 PRP39YML046W 1890 nt0.05□□□□□ -2.4
SED1Q01589 VIK1YPL253C 1944 nt0.05□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.05□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.05□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YPL225WYPL225W 441 nt0.05□□□□□ -2.4
SED1Q01589 SEC8YPR055W 3198 nt0.05□□□□□ -2.4
SED1Q01589 PAA1YDR071C 576 nt0.04□□□□□ -2.4
SED1Q01589 RPS26AYGL189C 360 nt0.04□□□□□ -2.4
SED1Q01589 ECL1YGR146C 636 nt0.04□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.04□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.04□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YLR456WYLR456W 615 nt0.04□□□□□ -2.4
SED1Q01589 SPO21YOL091W 1830 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 PTP2YOR208W 2253 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 COY1YKL179C 2040 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 CSN9YDR179C 489 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YJL120WYJL120W 324 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YOR053WYOR053W 342 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YPL068CYPL068C 882 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 snR190snR190 190 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 snR45snR45 172 nt0.03□□□□□ -2.4
SED1Q01589 YLR434CYLR434C 384 nt0.02□□□□□ -2.41
SED1Q01589 YNL146WYNL146W 303 nt0.02□□□□□ -2.41
SED1Q01589 ATP19YOL077W-A 207 nt0.02□□□□□ -2.41
SED1Q01589 YDL158CYDL158C 309 nt0.01□□□□□ -2.41
SED1Q01589 COX12YLR038C 252 nt0.01□□□□□ -2.41
SED1Q01589 RPS25BYLR333C 327 nt0.01□□□□□ -2.41
SED1Q01589 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0□□□□□ -2.41
SED1Q01589 ULI1YFR026C 510 nt0□□□□□ -2.41
SED1Q01589 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0□□□□□ -2.41
SED1Q01589 YPR092WYPR092W 306 nt0□□□□□ -2.41
SED1Q01589 NNF2YGR089W 2811 nt-0□□□□□ -2.41
SED1Q01589 SOV1YMR066W 2697 nt-0□□□□□ -2.41
SED1Q01589 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.01□□□□□ -2.41
SED1Q01589 HMRA2YCR096C 360 nt-0.01□□□□□ -2.41
SED1Q01589 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-0.01□□□□□ -2.41
SED1Q01589 NIP1YMR309C 2439 nt-0.01□□□□□ -2.41
SED1Q01589 SSS1YDR086C 243 nt-0.02□□□□□ -2.41
SED1Q01589 PCC1YKR095W-A 267 nt-0.02□□□□□ -2.41
SED1Q01589 YAR029WYAR029W 225 nt-0.02□□□□□ -2.41
SED1Q01589 VPS20YMR077C 666 nt-0.03□□□□□ -2.41
SED1Q01589 YEL073CYEL073C 324 nt-0.04□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YHR138CYHR138C 345 nt-0.04□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YLR282CYLR282C 342 nt-0.04□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.04□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.04□□□□□ -2.42
SED1Q01589 COG8YML071C 1824 nt-0.05□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YCR022CYCR022C 345 nt-0.05□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-0.05□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.05□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.05□□□□□ -2.42
SED1Q01589 PRM3YPL192C 402 nt-0.05□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YKU70YMR284W 1809 nt-0.06□□□□□ -2.42
SED1Q01589 CSE1YGL238W 2883 nt-0.06□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YER137W-AYER137W-A 306 nt-0.06□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.06□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.06□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YAR053WYAR053W 297 nt-0.06□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YLR232WYLR232W 348 nt-0.06□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-0.06□□□□□ -2.42
SED1Q01589 RPL35AYDL191W 363 nt-0.07□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.07□□□□□ -2.42
SED1Q01589 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.07□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YKL136WYKL136W 399 nt-0.07□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YNL303WYNL303W 348 nt-0.07□□□□□ -2.42
SED1Q01589 snR189snR189 189 nt-0.08□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YER079WYER079W 633 nt-0.09□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-0.09□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YPL205CYPL205C 345 nt-0.09□□□□□ -2.42
SED1Q01589 YLR041WYLR041W 321 nt-0.11□□□□□ -2.43
SED1Q01589 HTB2YBL002W 396 nt-0.11□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.11□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YBR285WYBR285W 435 nt-0.11□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YDR048CYDR048C 315 nt-0.12□□□□□ -2.43
SED1Q01589 SNU13YEL026W 381 nt-0.12□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.12□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YGR069WYGR069W 336 nt-0.12□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.12□□□□□ -2.43
SED1Q01589 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.13□□□□□ -2.43
SED1Q01589 RPS27BYHR021C 249 nt-0.13□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YJR157WYJR157W 363 nt-0.13□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YOR121CYOR121C 306 nt-0.13□□□□□ -2.43
SED1Q01589 snR8snR8 190 nt-0.14□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YFL063WYFL063W 456 nt-0.14□□□□□ -2.43
SED1Q01589 snR128snR128 126 nt-0.14□□□□□ -2.43
SED1Q01589 TAH1YCR060W 336 nt-0.15□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YDR366CYDR366C 399 nt-0.15□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.15□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.15□□□□□ -2.43
SED1Q01589 YJL007CYJL007C 315 nt-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.3 ms