Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms