Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNU13P55769 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNU13P55769 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNU13P55769 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNU13P55769 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNU13P55769 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNU13P55769 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNU13P55769 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNU13P55769 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms