Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNA2P51530 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DNA2P51530 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DNA2P51530 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNA2P51530 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms