Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP4P49662 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP4P49662 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP4P49662 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP4P49662 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP4P49662 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP4P49662 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP4P49662 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP4P49662 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP4P49662 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP4P49662 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP4P49662 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP4P49662 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms