Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A3P48764 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A3P48764 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A3P48764 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC9A3P48764 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms