Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AFMP43652 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMP43652 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMP43652 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMP43652 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFMP43652 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFMP43652 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms