Protein–RNA interactions for Protein: P40003

VAB2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit VAB2, yeastyeast

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAB2P40003 YDR157WYDR157W 402 nt0.66□□□□□ -2.3
VAB2P40003 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.66□□□□□ -2.3
VAB2P40003 MCM10YIL150C 1716 nt0.66□□□□□ -2.3
VAB2P40003 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.65□□□□□ -2.31
VAB2P40003 BIL1YOR304C-A 231 nt0.65□□□□□ -2.31
VAB2P40003 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.64□□□□□ -2.31
VAB2P40003 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
VAB2P40003 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.64□□□□□ -2.31
VAB2P40003 SPO21YOL091W 1830 nt0.64□□□□□ -2.31
VAB2P40003 PMP1YCR024C-A 123 nt0.63□□□□□ -2.31
VAB2P40003 RPL35AYDL191W 363 nt0.63□□□□□ -2.31
VAB2P40003 UTP8YGR128C 2142 nt0.63□□□□□ -2.31
VAB2P40003 HTB2YBL002W 396 nt0.63□□□□□ -2.31
VAB2P40003 YLR334CYLR334C 381 nt0.63□□□□□ -2.31
VAB2P40003 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.63□□□□□ -2.31
VAB2P40003 IQG1YPL242C 4488 nt0.62□□□□□ -2.31
VAB2P40003 NOP9YJL010C 2001 nt0.62□□□□□ -2.31
VAB2P40003 YGR035CYGR035C 351 nt0.62□□□□□ -2.31
VAB2P40003 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.62□□□□□ -2.31
VAB2P40003 PAA1YDR071C 576 nt0.61□□□□□ -2.31
VAB2P40003 NPR2YEL062W 1848 nt0.6□□□□□ -2.31
VAB2P40003 RPS25BYLR333C 327 nt0.6□□□□□ -2.31
VAB2P40003 BUL2YML111W 2763 nt0.6□□□□□ -2.31
VAB2P40003 THO2YNL139C 4794 nt0.59□□□□□ -2.31
VAB2P40003 RPL26BYGR034W 384 nt0.57□□□□□ -2.32
VAB2P40003 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.57□□□□□ -2.32
VAB2P40003 YNL211CYNL211C 261 nt0.57□□□□□ -2.32
VAB2P40003 SGF11YPL047W 300 nt0.57□□□□□ -2.32
VAB2P40003 CHS6YJL099W 2241 nt0.56□□□□□ -2.32
VAB2P40003 YDR048CYDR048C 315 nt0.56□□□□□ -2.32
VAB2P40003 YJL120WYJL120W 324 nt0.56□□□□□ -2.32
VAB2P40003 YPL225WYPL225W 441 nt0.55□□□□□ -2.32
VAB2P40003 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
VAB2P40003 YML002WYML002W 2214 nt0.54□□□□□ -2.32
VAB2P40003 SSS1YDR086C 243 nt0.54□□□□□ -2.32
VAB2P40003 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.54□□□□□ -2.32
VAB2P40003 TAR1YLR154W-C 375 nt0.54□□□□□ -2.32
VAB2P40003 STE5YDR103W 2754 nt0.51□□□□□ -2.33
VAB2P40003 YFL019CYFL019C 354 nt0.51□□□□□ -2.33
VAB2P40003 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.51□□□□□ -2.33
VAB2P40003 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.51□□□□□ -2.33
VAB2P40003 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.5□□□□□ -2.33
VAB2P40003 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.5□□□□□ -2.33
VAB2P40003 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.49□□□□□ -2.33
VAB2P40003 ASE1YOR058C 2658 nt0.49□□□□□ -2.33
VAB2P40003 SEC8YPR055W 3198 nt0.49□□□□□ -2.33
VAB2P40003 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.48□□□□□ -2.33
VAB2P40003 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.48□□□□□ -2.33
VAB2P40003 FYV10YIL097W 1551 nt0.48□□□□□ -2.33
VAB2P40003 LTE1YAL024C 4308 nt0.47□□□□□ -2.33
VAB2P40003 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.47□□□□□ -2.33
VAB2P40003 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.47□□□□□ -2.33
VAB2P40003 COG8YML071C 1824 nt0.47□□□□□ -2.33
VAB2P40003 RPS27BYHR021C 249 nt0.46□□□□□ -2.34
VAB2P40003 COX5BYIL111W 456 nt0.46□□□□□ -2.34
VAB2P40003 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.46□□□□□ -2.34
VAB2P40003 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.45□□□□□ -2.34
VAB2P40003 CSE2YNR010W 450 nt0.45□□□□□ -2.34
VAB2P40003 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.44□□□□□ -2.34
VAB2P40003 YAF9YNL107W 681 nt0.44□□□□□ -2.34
VAB2P40003 snR190snR190 190 nt0.44□□□□□ -2.34
VAB2P40003 snR60snR60 104 nt0.43□□□□□ -2.34
VAB2P40003 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.43□□□□□ -2.34
VAB2P40003 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.43□□□□□ -2.34
VAB2P40003 YPR012WYPR012W 255 nt0.43□□□□□ -2.34
VAB2P40003 PET111YMR257C 2403 nt0.43□□□□□ -2.34
VAB2P40003 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.42□□□□□ -2.34
VAB2P40003 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.42□□□□□ -2.34
VAB2P40003 YPR197CYPR197C 564 nt0.42□□□□□ -2.34
VAB2P40003 VIK1YPL253C 1944 nt0.42□□□□□ -2.34
VAB2P40003 PRP5YBR237W 2550 nt0.41□□□□□ -2.34
VAB2P40003 OST4YDL232W 111 nt0.4□□□□□ -2.35
VAB2P40003 YDR102CYDR102C 333 nt0.4□□□□□ -2.35
VAB2P40003 PRP42YDR235W 1635 nt0.39□□□□□ -2.35
VAB2P40003 SBH1YER087C-B 249 nt0.39□□□□□ -2.35
VAB2P40003 YIL032CYIL032C 357 nt0.39□□□□□ -2.35
VAB2P40003 YSP1YHR155W 3687 nt0.39□□□□□ -2.35
VAB2P40003 HTL1YCR020W-B 237 nt0.38□□□□□ -2.35
VAB2P40003 YKL136WYKL136W 399 nt0.38□□□□□ -2.35
VAB2P40003 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.37□□□□□ -2.35
VAB2P40003 HAL9YOL089C 3093 nt0.36□□□□□ -2.35
VAB2P40003 PRP39YML046W 1890 nt0.36□□□□□ -2.35
VAB2P40003 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.36□□□□□ -2.35
VAB2P40003 YLR282CYLR282C 342 nt0.35□□□□□ -2.35
VAB2P40003 snR36snR36 182 nt0.35□□□□□ -2.35
VAB2P40003 TAH1YCR060W 336 nt0.34□□□□□ -2.36
VAB2P40003 YGL149WYGL149W 306 nt0.34□□□□□ -2.36
VAB2P40003 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.34□□□□□ -2.36
VAB2P40003 COY1YKL179C 2040 nt0.34□□□□□ -2.36
VAB2P40003 MLP1YKR095W 5628 nt0.33□□□□□ -2.36
VAB2P40003 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.33□□□□□ -2.36
VAB2P40003 YOR345CYOR345C 351 nt0.33□□□□□ -2.36
VAB2P40003 BEM3YPL115C 3387 nt0.33□□□□□ -2.36
VAB2P40003 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.32□□□□□ -2.36
VAB2P40003 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.32□□□□□ -2.36
VAB2P40003 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.32□□□□□ -2.36
VAB2P40003 ABF2YMR072W 552 nt0.32□□□□□ -2.36
VAB2P40003 YPR092WYPR092W 306 nt0.32□□□□□ -2.36
VAB2P40003 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.3□□□□□ -2.36
VAB2P40003 ULI1YFR026C 510 nt0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.1 ms