Protein–RNA interactions for Protein: P38864

YHR173C, Uncharacterized protein YHR173C, yeastyeast

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR173CP38864 NIP100YPL174C 2607 nt-0.51□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 TSC3YBR058C-A 243 nt-0.51□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 DIE2YGR227W 1578 nt-0.52□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 YKL044WYKL044W 321 nt-0.52□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 snR46snR46 197 nt-0.52□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 PCF11YDR228C 1881 nt-0.52□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 YER175W-AYER175W-A 165 nt-0.53□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 YIL029CYIL029C 429 nt-0.53□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 YPL205CYPL205C 345 nt-0.53□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 SVS1YPL163C 783 nt-0.54□□□□□ -2.5
YHR173CP38864 YPL225WYPL225W 441 nt-0.54□□□□□ -2.5
YHR173CP38864 RPF1YHR088W 888 nt-0.55□□□□□ -2.5
YHR173CP38864 YNL058CYNL058C 951 nt-0.55□□□□□ -2.5
YHR173CP38864 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.56□□□□□ -2.5
YHR173CP38864 YCR100CYCR100C 951 nt-0.57□□□□□ -2.5
YHR173CP38864 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.57□□□□□ -2.5
YHR173CP38864 YCR022CYCR022C 345 nt-0.58□□□□□ -2.5
YHR173CP38864 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.59□□□□□ -2.5
YHR173CP38864 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.59□□□□□ -2.5
YHR173CP38864 YDL011CYDL011C 324 nt-0.6□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YLR282CYLR282C 342 nt-0.6□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YBL071CYBL071C 309 nt-0.62□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 ZEO1YOL109W 342 nt-0.62□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.62□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.62□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 HMRA2YCR096C 360 nt-0.63□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 EST1YLR233C 2100 nt-0.63□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YLR269CYLR269C 351 nt-0.63□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.63□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YBR099CYBR099C 384 nt-0.63□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 URB1YKL014C 5295 nt-0.63□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YHR138CYHR138C 345 nt-0.64□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YLR334CYLR334C 381 nt-0.64□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YPL229WYPL229W 621 nt-0.64□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YDL016CYDL016C 303 nt-0.65□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YKL083WYKL083W 615 nt-0.65□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.65□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.65□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.65□□□□□ -2.51
YHR173CP38864 YDR426CYDR426C 378 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 SNU13YEL026W 381 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 FYV7YLR068W 456 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 RPS25BYLR333C 327 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 MRPS8YMR158W 468 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-0.67□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 BLI1YKL061W 342 nt-0.67□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.67□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YPL068CYPL068C 882 nt-0.67□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 GLG1YKR058W 1851 nt-0.67□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YAL066WYAL066W 309 nt-0.68□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.69□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YJL120WYJL120W 324 nt-0.69□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-0.69□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-0.7□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.7□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.71□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 GPI15YNL038W 690 nt-0.72□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YNL303WYNL303W 348 nt-0.72□□□□□ -2.52
YHR173CP38864 YDR366CYDR366C 399 nt-0.73□□□□□ -2.53
YHR173CP38864 RPM2YML091C 3609 nt-0.74□□□□□ -2.53
YHR173CP38864 GRX5YPL059W 453 nt-0.74□□□□□ -2.53
YHR173CP38864 snR33snR33 183 nt-0.74□□□□□ -2.53
YHR173CP38864 YLR041WYLR041W 321 nt-0.75□□□□□ -2.53
YHR173CP38864 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.75□□□□□ -2.53
YHR173CP38864 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.76□□□□□ -2.53
YHR173CP38864 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-0.76□□□□□ -2.53
YHR173CP38864 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.77□□□□□ -2.53
YHR173CP38864 YAR047CYAR047C 321 nt-0.78□□□□□ -2.53
YHR173CP38864 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.79□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 YFL012WYFL012W 447 nt-0.79□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 PCC1YKR095W-A 267 nt-0.79□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.8□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.82□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 YER079WYER079W 633 nt-0.82□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 YHR130CYHR130C 336 nt-0.82□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 YLR456WYLR456W 615 nt-0.82□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 CBS1YDL069C 690 nt-0.83□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 AGA2YGL032C 264 nt-0.83□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 YER084W-AYER084W-A 513 nt-0.84□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 AIM29YKR074W 468 nt-0.84□□□□□ -2.54
YHR173CP38864 YAR029WYAR029W 225 nt-0.86□□□□□ -2.55
YHR173CP38864 PRM3YPL192C 402 nt-0.86□□□□□ -2.55
YHR173CP38864 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.87□□□□□ -2.55
YHR173CP38864 MPC1YGL080W 393 nt-0.87□□□□□ -2.55
YHR173CP38864 YHR125WYHR125W 306 nt-0.87□□□□□ -2.55
YHR173CP38864 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.88□□□□□ -2.55
YHR173CP38864 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.88□□□□□ -2.55
YHR173CP38864 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.89□□□□□ -2.55
YHR173CP38864 YFL063WYFL063W 456 nt-0.91□□□□□ -2.56
YHR173CP38864 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-0.91□□□□□ -2.56
YHR173CP38864 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-0.91□□□□□ -2.56
YHR173CP38864 CSN9YDR179C 489 nt-0.93□□□□□ -2.56
YHR173CP38864 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.93□□□□□ -2.56
YHR173CP38864 TAH1YCR060W 336 nt-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.4 ms