Protein–RNA interactions for Protein: P34241

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 1,764 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URB1	P34241	BER1	YLR412W	825 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
URB1	P34241	IPP1	YBR011C	864 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
URB1	P34241	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	HMRA2	YCR096C	360 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YMR254C	YMR254C	309 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YER135C	YER135C	393 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YNR077C	YNR077C	255 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YCR001W	YCR001W	315 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YCR022C	YCR022C	345 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YDR210W	YDR210W	228 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	SDH7	YDR511W	402 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YIR030W-A	YIR030W-A	384 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YJL120W	YJL120W	324 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YOR345C	YOR345C	351 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YKL044W	YKL044W	321 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	CMC1	YKL137W	336 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	TAR1	YLR154W-C	375 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YPL205C	YPL205C	345 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		-0.6	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	SCEI	Q0160	708 nt		-0.6	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YLR334C	YLR334C	381 nt		-0.6	□□□□□ -2.5
URB1	P34241	YBL071C	YBL071C	309 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	RPS25B	YLR333C	327 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	RPF1	YHR088W	888 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	YLR287C	YLR287C	1068 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	SGF11	YPL047W	300 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	MND1	YGL183C	660 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	YHR007C-A	YHR007C-A	216 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	YIL029C	YIL029C	429 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
URB1	P34241	YHR138C	YHR138C	345 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	snR33	snR33	183 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	PCF11	YDR228C	1881 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YPR002C-A	YPR002C-A	198 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YPL068C	YPL068C	882 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YBR099C	YBR099C	384 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YCR100C	YCR100C	951 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YDR426C	YDR426C	378 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	MRPS8	YMR158W	468 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YNL303W	YNL303W	348 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	GRX5	YPL059W	453 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YPL229W	YPL229W	621 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YLR282C	YLR282C	342 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	YJR087W	YJR087W	351 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	FYV7	YLR068W	456 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	ZEO1	YOL109W	342 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
URB1	P34241	SNU13	YEL026W	381 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YPR092W	YPR092W	306 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YDL016C	YDL016C	303 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YDR366C	YDR366C	399 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	AIM29	YKR074W	468 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	EST1	YLR233C	2100 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YLR041W	YLR041W	321 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	AGA2	YGL032C	264 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YGL123C-A	YGL123C-A	231 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YAL066W	YAL066W	309 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
URB1	P34241	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
URB1	P34241	YAR029W	YAR029W	225 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
URB1	P34241	YKL083W	YKL083W	615 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
URB1	P34241	YKL100W-A	YKL100W-A	90 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
URB1	P34241	BLI1	YKL061W	342 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
URB1	P34241	YLR456W	YLR456W	615 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
URB1	P34241	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
URB1	P34241	YDR354C-A	YDR354C-A	144 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
URB1	P34241	YFL012W	YFL012W	447 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
URB1	P34241	YGR174W-A	YGR174W-A	87 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
URB1	P34241	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
URB1	P34241	YAR047C	YAR047C	321 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
URB1	P34241	SDH6	YDR379C-A	240 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
URB1	P34241	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
URB1	P34241	YOL038C-A	YOL038C-A	96 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
URB1	P34241	YOR192C-C	YOR192C-C	237 nt		-0.91	□□□□□ -2.55
URB1	P34241	snR54	snR54	86 nt		-0.91	□□□□□ -2.55
URB1	P34241	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
URB1	P34241	YER079W	YER079W	633 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
URB1	P34241	GPI15	YNL038W	690 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
URB1	P34241	PCC1	YKR095W-A	267 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
URB1	P34241	YEL020C-B	YEL020C-B	198 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
URB1	P34241	YOR161W-A	YOR161W-A	81 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
URB1	P34241	YFL063W	YFL063W	456 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
URB1	P34241	RPS27B	YHR021C	249 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
URB1	P34241	YER053C-A	YER053C-A	114 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
URB1	P34241	YLR269C	YLR269C	351 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
URB1	P34241	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		-1	□□□□□ -2.57
URB1	P34241	YHR130C	YHR130C	336 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
URB1	P34241	CSE2	YNR010W	450 nt		-1.01	□□□□□ -2.57

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