Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP1P29466 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP1P29466 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP1P29466 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP1P29466 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP1P29466 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP1P29466 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP1P29466 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP1P29466 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP1P29466 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms