Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms