Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSP20132 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDSP20132 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDSP20132 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDSP20132 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDSP20132 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDSP20132 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SDSP20132 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDSP20132 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDSP20132 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDSP20132 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SDSP20132 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDSP20132 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDSP20132 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms