Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNNI3P19429 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNNI3P19429 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms