Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XBP1P17861 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XBP1P17861 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
XBP1P17861 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XBP1P17861 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XBP1P17861 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XBP1P17861 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms