Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms