Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms