Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL11A1P12107 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms