Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD2P0DJD1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD2P0DJD1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms