Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI1P08151 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI1P08151 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI1P08151 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI1P08151 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms