Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSLP07711 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSLP07711 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSLP07711 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSLP07711 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSLP07711 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSLP07711 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSLP07711 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSLP07711 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSLP07711 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSLP07711 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSLP07711 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSLP07711 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSLP07711 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSLP07711 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSLP07711 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSLP07711 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms