Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX58O95786 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX58O95786 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX58O95786 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX58O95786 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX58O95786 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX58O95786 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX58O95786 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX58O95786 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX58O95786 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX58O95786 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDX58O95786 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDX58O95786 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDX58O95786 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX58O95786 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX58O95786 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX58O95786 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms