Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms