Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms