Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms