Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTZ2

CCDC196, Putative coiled-coil domain-containing protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC196A0A1B0GTZ2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC196A0A1B0GTZ2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms