Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms