Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 OR5P3-201ENST00000328375 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AGKP1-201ENST00000455254 1263 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC099687.1-201ENST00000531798 510 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AL121985.1-203ENST00000588034 556 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 TMEM116-201ENST00000355445 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 CYP3A43-202ENST00000312017 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC243547.1-201ENST00000415065 408 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RBM22P7-201ENST00000421321 280 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RPL4P2-201ENST00000447259 1282 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RPS12P20-201ENST00000464109 380 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RN7SL508P-201ENST00000464472 303 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AP001124.1-201ENST00000529628 385 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 SYTL2-228ENST00000533892 1441 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC006206.2-201ENST00000537192 992 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 SUPT16H-204ENST00000555943 915 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ULK4P3-201ENST00000563895 440 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC091132.5-205ENST00000585761 560 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 LINC00595-211ENST00000634735 535 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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