Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 TPP2-202ENST00000376065 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 PPP1R3B-201ENST00000310455 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 NOTCH2NL-203ENST00000578207 5042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 OR8D4-202ENST00000641687 2904 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 LINC01519-201ENST00000454178 2029 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 USP32P1-203ENST00000417524 1014 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 GIT2-205ENST00000457474 5291 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SIPA1L2-201ENST00000262861 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ZNF322-208ENST00000622479 4882 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 DARS2-201ENST00000361951 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 THAP12P3-201ENST00000456373 2266 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 STAG3-219ENST00000620100 4203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 EIF4BP5-201ENST00000567338 1795 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 FGFR2-206ENST00000358487 4255 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 OR2A20P-201ENST00000479887 2913 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SIDT2-219ENST00000620360 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms