Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA3Q9Y6H8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms