Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms